استفاده طولانی مدت از کودهای شیمیایی خاک را تخریب می کند و بر عملکرد محصول تأثیر می گذارد. در نتیجه باید به فکر جایگزین بود. کود زیستی ماده ای حاوی میکروارگانیسم های زنده است که خواص مفیدی برای رشد و نمو گیاهان از خود نشان می دهد. مکانیسم های مختلفی توسط سویه های میکروبی به منظور افزایش جذب مواد مغذی، بهبود حاصلخیزی خاک و افزایش عملکرد محصولات مانند تثبیت نیتروژن، حل شدن پتاسیم و فسفر، دفع هورمون های گیاهی، تولید مواد سرکوب کننده پاتوژن های گیاهی، محافظت از تنش های زیستی و تنش های زیستی گیاهان و عوامل محیطی استفاده می شود. آلاینده ها در خاک با در نظر گرفتن نیازهای رو به رشد مصرف و خطرات ناشی از استفاده بیش از حد از کودهای شیمیایی و آفت کش ها، باعث شده است که کودهای زیستی جایگزین امیدوارکننده و غیر سمی برای مواد شیمیایی کشاورزی مصنوعی، از جمله کنترل قارچها و به حداقل رساندن آلودگی مایکوتوکسین ها باشند. اجرای تلقیحهای میکروبی برای غلبه بر کاستیهای مرتبط با تکنیکهای کشاورزی مبتنی بر شیمیایی در نظر گرفته میشود، بنابراین توجه و تحقیق در مورد استفاده گسترده از کودهای زیستی یکی از جریانهای اصلی کار علمی برای توسعه کشاورزی پایدار است..
